Ayvalık merkezde konaklamak isteyenler için butik oteller, şehrin tarihi dokusuna yakın, deniz manzaralı ve kişisel hizmet sunan seçenekler sunar. Bu oteller genellikle yürüme mesafesinde sahil, restoranlar ve alışveriş noktalarına sahiptir. Fiyatlar geniş bir aralıkta olup, bütçe dostu seçeneklerden lüks odalara kadar çeşitlilik gösterir. Öne çıkan oteller arasında Ferahi Evler Ayvalik, tamamen sigara içilmeyen yapısı, ücretsiz Wi-Fi ve Ege Denizi manzaralı odalarıyla dikkat çeker. Şirin Garden Ayvalik ise süper puanı, bahçesi ve merkezi konumuyla öne çıkar.
Merkez butik otellerde genellikle kahvaltı dahil, bazılarında havuz ve spa gibi ek olanaklar bulunur. Ayvalık Palas Hotel uygun fiyatlı aile odaları sunarken, Bacacan Otel deniz manzarası ve elektrikli araç şarj istasyonuyla fark yaratır. Konaklama seçerken otopark, havaalanı servisi ve oda tipi gibi detayları kontrol etmek önemlidir. Ayvalık merkezdeki butik oteller, şehir turu veya ada feribotlarına kolay erişim için idealdir.